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部落格全站分類:生活綜合

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  • 11月 15 週日 200922:40
  • Neural network code or tool

因為研究的關係,需要neural network(註1)的技術。
基本上我們可以使用neural network,透過一組dataset讓它學習其中的規則
然後靠著這個規則來判斷我們想要知的答案。

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febain 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣(3,190)

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  • 10月 24 週六 200915:53
  • SOV(segment overlap) measure JAVA program

SOV(segment overlap)是測量預測蛋白質二級體結構的一種方法

跟Q3的方法不同的是以片段的觀念比較


以下用例子說明:
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febain 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣(409)

  • 個人分類:蛋白質二級結構預測
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  • 2月 01 週日 200911:32
  • Outlook Express 讀不到備份的信件

outlook_express_1.bmp
Outlook Express郵件存放的路徑

要知道你自己Outlook Express郵件存放的路徑的話
Outlook Express => 工具 => 選項 => 維護 => 郵件檔資料夾
就會看到如下圖所示
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febain 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣(682)

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  • 1月 04 週日 200916:14
  • PSIPRED安裝使用教學

pic.jpg
更新時間 2011/12/17
PSIPRED簡介
PSIPRED是一個蛋白質二級結構預測的軟體,使用neural networks的方法來建立預測model。大致上的原理將要預測的蛋白質,是先透過PSI-BLAST工具找出與此相關的蛋白質,藉此得到演化上資訊,如amino acid的改變、insertion或是deletion等等。跟據此結果輸入到neural network,來預測可能的二級預測結構。(詳細的內容,請看Jones DT. (1999) Protein secondary structure prediction based on position-specific scoring matrices. J. Mol. Biol. 292: 195-202.這篇paper)
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febain 發表在 痞客邦 留言(7) 人氣(2,371)

  • 個人分類:蛋白質二級結構預測
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  • [11/10/14] quan gu 於文章「PSIPRED安裝使用教學...」發表了一則私密留言
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    请问可以循环输入输出么?比如我有100条序列(fasta结构...
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    你好,想請教版主些問題 我是下載psipred32版本(p...
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    我是用cygwin當作業環境 我的目錄是/home/ps 我...
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    最近想用 sspro4 但是那是在 linux 上跑得 ...

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