因為研究的關係,需要neural network(註1)的技術。
基本上我們可以使用neural network,透過一組dataset讓它學習其中的規則
然後靠著這個規則來判斷我們想要知的答案。
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SOV(segment overlap)是測量預測蛋白質二級體結構的一種方法
跟Q3的方法不同的是以片段的觀念比較
以下用例子說明:
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Outlook Express郵件存放的路徑
要知道你自己Outlook Express郵件存放的路徑的話
Outlook Express => 工具 => 選項 => 維護 => 郵件檔資料夾
就會看到如下圖所示febain 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣(682)
更新時間 2011/12/17
PSIPRED簡介
PSIPRED是一個蛋白質二級結構預測的軟體,使用
neural networks的方法來建立預測model。大致上的原理將要預測的蛋白質,是先透過PSI-BLAST工具找出與此相關的蛋白質,藉此得到演化上資訊,如amino acid的改變、insertion或是deletion等等。
跟據此結果輸入到neural network,來預測可能的二級預測結構。(詳細的內容,請看Jones DT. (1999) Protein secondary structure prediction based on position-specific scoring matrices. J. Mol. Biol. 292: 195-202.這篇paper)
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